Muzeum v Netvořicích vzniklo jako městské v roce 1919 za podpory obce a Spolku rodáků z Netvořic a okolí. Původně sídlilo v domě č.p. 7, v roce 1924 získalo samostatný objekt, v němž sídlí dodnes. Muzeum má pozoruhodnou sbírku Týnecké kameniny, dále sbírku užitého umění a předmětů lidové tvořivosti - mince, medaile, plakety a vyznamenání.
Muzeum vzniklo zásluhou Muzejního spolku pro zachování památek Netvořic a okolí, jehož ustavující schůze se konala 1. listopadu 1919. Koncem roku 1922 měl Muzejní spolek 126 členů. Hlavními podporovateli vznikajícího muzea byla netvořická obec a pražský „Spolek rodáků z Netvořic a okolí“. Základ sbírek tvořily většinou dary od členů Spolku rodáků. V roce 1924 přidělilo obecní zastupitelstvo muzeu a jeho rozrůstajícím se sbírkám domek se zahrádkou v prostoru bývalého panského dvora. Ten byl v roce 1931 rozšířen a přibylo také patro. Tím dostala budova muzea dnešní podobu.
Do začátku 2. světové války pracovali členové Muzejního spolku na zušlechťování a doplňování sbírek, především se podařilo získat ojedinělou sbírku výrobků zaniklé manufaktury na kameninu v Týnci nad Sázavou. Tato činnost byla násilně přerušena okupací a následným nuceným vystěhováním Netvořicka. Muzejní sbírky byly převezeny ve spěchu do Benešova. Po konci války s návratem vysídlených Netvořáků začal opět pracovat Muzejní spolek. Jeho zásluhou se v roce 1947 většina muzejních exponátů vrátila zpět. V roce 1952 po zastavení činnosti spolku přešla správa muzea pod netvořickou obec.
V devadesátých letech minulého století začalo docházet k postupné rekonstrukci budovy muzea a lepšímu uspořádání sbírek. Byla také obnovena činnost rodáckého spolku, který znovuvznikl pod jménem „Spolek rodáků a přátel muzea v Netvořících“.