Het museum werd in 1990 opgericht door het districtskantoor in Benešov als Galerie voor Schone Kunsten. In de eerste jaren werd het publiek alleen bediend door de tentoonstellingszaal, de open studio en de mediaruimte. De tentoonstellingen zetten een veertigjarige traditie voort van kunstpresentaties in de zogenaamde Ladislav Šíma zaal, een Benesov schilder en musicus. Acquisitieactiviteiten, gesteund door het Tsjechisch Museum voor Schone Kunsten en lokale donateurs, ontwikkelden zich ook geleidelijk. Een permanente tentoonstelling van regionale kunst, een theesalon en later permanente installaties van Tsjechische kunst uit de 20e eeuw - grafiek, fotografie, grafisch ontwerp, beeldhouwkunst en schilderkunst - werden opengesteld voor het publiek.
Het museum gebruikt ook de externe tentoonstellingsruimte in de foyer van de stadsbibliotheek voor zijn activiteiten, niet alleen voor tentoonstellingen maar ook voor educatieve en culturele evenementen. Een andere externe tentoonstelling is op de begane grond van het Piaristencollege in de Sint-Annakerk op het Masarykplein. Sinds 2016 beheert het de ondergrondse Benešov onder het stadhuis, waar momenteel de zogenaamde Experimenta is, een tentoonstelling die speciaal geschikt is voor kinderen.
Naast het beheer van de collectie richt het programma van het museum zich op het organiseren van culturele evenementen, lezingen, voordrachten, concerten, filmvoorstellingen en kunstworkshops voor het publiek. Op dit moment omvat de collectie objecten op het gebied van schilderkunst, grafiek, fotografie, beeldhouwkunst en design. De collectie omvat ongeveer 13.000 objecten, waarvoor nu nieuwe depots worden gecreëerd in verband met de renovatie van het hoofdgebouw. Het museum is lid van de Raad van Galerieën van Tsjechië en de Vereniging van Musea en Galerieën van Tsjechië.
De langetermijntentoonstelling over de geschiedenis van de regio Benešov, die bij de Benešov-tak van het Museum van Podblanicko hoort, is ook tijdelijk toegankelijk via het Kunstmuseum - het is gesloten vanaf 2 oktober 2023 en zal verhuizen naar het Piaristencollege, waar het op zijn vroegst in 2025 geopend zou moeten worden.